药物活性成分和靶点筛选
中药主要活性成分研究
1.1利用UHPLC-QTOF-MS分析中药的主要活性物质
图1样品UHPLC-QTOF-MS检测正离子模式TIC图
图2样品UHPLC-QTOF-MS检测负离子模式TIC图
图3 样品主要组成
1.2 利用中药研究数据库研究中药主要活性成分
利用中药研究数据库,根据中药的ADME参数,找出有药用开发价值的活性成分。
Mol ID | Molecule Name | MW | OB (%) | Caco-2 | DL | Compound structure |
MOL002467 | 6-gingerol | 294.43 | 35.64 | 0.54 | 0.16 | |
MOL002495 | 6-shogaol | 276.41 | 31 | 1.07 | 0.14 | |
MOL000131 | EIC | 280.5 | 41.9 | 1.16 | 0.14 | |
MOL000432 | linolenic acid | 278.48 | 45.01 | 1.21 | 0.15 | |
MOL000449 | Stigmasterol | 412.77 | 43.83 | 1.44 | 0.76 | |
MOL000676 | DBP | 278.38 | 64.54 | 0.8 | 0.13 | |
MOL001945 | Majudin | 216.2 | 42.21 | 0.94 | 0.13 | |
MOL003358 | Euxanthone | 228.21 | 92.98 | 0.68 | 0.16 | |
MOL008698 | Dihydrocapsaicin | 307.48 | 47.07 | 0.98 | 0.19 |
活性成份靶点分析
利用中药研究数据库,研究活性成分对应的人体生物靶标。
Uniprot | Gene symbol | Protein names |
P35354 | PTGS2 | prostaglandin-endoperoxide synthase 2 |
P23975 | SLC6A2 | solute carrier family 6 member 2 |
Q01959 | SLC6A3 | solute carrier family 6 member 3 |
P16389 | KCNA2 | potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 |
P23219 | PTGS1 | prostaglandin-endoperoxide synthase 1 |
P08235 | NR3C2 | nuclear receptor subfamily 3 group C member 2 |
P08913 | ADRA2A | adrenoceptor alpha 2A |
P36544 | CHRNA7 | cholinergic receptor nicotinic alpha 7 subunit |
Q14524 | SCN5A | sodium voltage-gated channel alpha subunit 5 |
P17538 | CTRB1 | chymotrypsinogen B1 |
P27338 | MAOB | monoamine oxidase B |
P28223 | HTR2A | 5-hydroxytryptamine receptor 2A |
表2 样品活性成份靶点筛选
化合物-靶点网络图
利用生物信息学技术手段分析活性成分与蛋白靶点之间的互作网络。
图4活性成分与蛋白靶点之间的互作网络图